・第55話「おれたち、デジモンハンター!」
2012年10月2日（日）放送

異世界・デジタルワールドにおけるバグラ帝国軍との戦いから1年が経過した人間界。

中学2年生に進級したタイキは、後輩となったユウや新主人公でお調子者の明石タギル（声：井上麻里奈）とともに、ストリートバスケチーム「クロスハート」を結成し、以前と変わらない日々を過ごしていた。
・・・ところがそんなある日、タギルはひょんなことから人間界とは異なる時間軸を持つ世界・「デジクオーツ」に紛れ込み、そこで暴れん坊の小竜型デジモン・ガムドラモン（声：渡辺久美子）と出会い、クオーツ内で暴れ回るデジモン達が引き起こす色んな怪事件を解決しながら、倒したデジモンを捕獲する「デジモンハント」に身を投じることになる。

というわけで第3期開始…。
タイキに代わり、新たな主人公となったタギルを始め、
今作から登場する新キャラクターとして、デジモンコレクターの戸張レン（声：桑島法子）、可愛いデジモンが目当ての少女・洲崎アイル（声：潘めぐみ）、
そして2人のリーダー格にして本作のライバルと目される最上リョウマ（声：柿原徹也）など、デジモンだけでなく人間側の新キャラも続々と登場する本作。
…特にアイルは可愛いな…アカリやネネがいない分、彼女に期待するしか・・・。
タギルの幼馴染の貴橋マミ（声：須藤祐実）って娘もいるけど、彼女は余り物語に関わることはなさそう…。

タギルにクロスローダーを手渡した時計屋のおやじ（声：草尾毅）。どーみてもただ者はないようだが、一体こやつは何者なのか…！？
ユウ…背も高くなって、たった1年で何だか変わり過ぎてる気が・・・。
それとガムドラモン→アレスタードラモンへの進化バンクと挿入歌がかっこいい。
　しかし、タイキやキリハが苦労して会得した超進化を、友情パワーだけで得てしまうとは…。発動の要因も色々あるんだろうけど・・・。

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・第56話「生徒たちが消えた! ゆらめくサゴモンの影」
2011年10月9日（日）放送

タギル達がデジモンハントやデジクオーツで話し合ってる頃、とある小学校でサゴモン（声：千葉繁）の手により、「消えたい」と願う子供達が次々と行方不明になる事件が発生。
事を知ったタギルとガムドラモンが挑むも、動きの素早いサゴモンの戦闘力に翻弄され、アレスタードラモンに超進化しても大ピンチに追いやられてしまう。
そんな時、タイキの「ほっとけない!」の声を聞き、デジタルワールドからシャウトモンが駆け付けた。

満を増してシャウトモン（＋クロスハートの仲間たち）登場。
以前の面影をそのままにしつつも念願のデジモンキングに就任したこともあって、内面的にも落ち着きと風格が出て、多少大人びた感じに…。
デザインも若干変えられて歴戦の勇者を表すためなのか、身体中の至るところにキズが・・・。あれどうしたんだ。。
とまあデザインは変えられたけど、オメガシャウトモンは進化バンクの背景以外、特に変更は無し。
やんちゃなガムドラモンも兄貴分の彼には頭が上がらず、まさにタイキとタギルの関係そのまんま…。
いつか彼らを超える日は来るのだろうか…！？＞タギル＆ガムドラモン。

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・第57話「ロボット部の夢、ピノッキモンの誘惑」
2011年10月16日（日）放送

かつてタイキがダストゾーンで助けたピノッキモン（声：難波圭一）が再登場。
何故かその時の記憶を失って、タイキ達が通う中学のロボット部の生徒らを誘惑し、前作で倒したブレイクドラモンの強化タイプである、ギガブレイクドラモンの建造に力を注いでいた彼。
記憶が元通りになっても誰もその事に疑問を感じないし、一体何があったのやら。

メタルティラノモン、サゴモンに続き、ギガブレイクドラモンをハントしたタギル。
超強力だけど、まだ未完成ゆえにリョウマ達でも手に負えないほどの暴走したあの力をタギルはどうコントロールしていくのかな…!?（使用することになればの話だけど）