ある日のひとりごと

コンピュータ科学専攻の私の講義ですが、内容としては、配列の比較、検索、機能予測、構造予測等のDNA等の生物配列解析に役立つようなアルゴリズムを中心に話をする予定です。生物には興味はなくとも文字列アルゴリズムに興味ある方などもどうぞ。なお、タイトルに「II」が付いていますが、単なる記号（！）ですので、気兼ねなくどうぞ。来年やる講義が「I」ですが、そちらでは違う授業をするかについてはまだ決めてません。
なお、情報の学部の講義で「情報科学特別講義３」（情報科学とバイオインフォマティクス）というのがあります。こちらは医科学研究所のコンピュータ科学専攻担当4教員がそれぞれ1ヶ月自分の研究分野の周辺の入門的な話をするものです。こちらでも文字列アルゴリズムを中心により入門的なことを話す予定です。内容は２つの授業で若干重なるところはあると思います。

http://earthquake.usgs.gov/recenteqsww/Quakes/usweax.htm
M8.7というと、余震というより別の地震といってもいいくらいの大きさの地震ですね。場所も、前回の余震域から南にはずれています。
日本でも安政の東海地震（今では同じ場所で起こる地震を東南海地震という＝今の想定東海地震と区別するため＝ややこしい命名しないでくれ〜ですね）の32時間後に南海地震がおきましたが、これは別の地震として扱うことが多いようです。これらの地震の規模がどちらもM8.4前後で同じ、という理由もあるかとは思いますが。ただ、これらの巨大地震でも今回の「余震」よりも小さく、恐るべしスマトラ地震です。
今後の余震域が気になります。

http://www.asahi.com/science/news/TKY200503240358.html
ほんとだとするとすごい。
いつぞやのNCBIのApril Foolネタを思い出します。

から帰ってきました。
バイオインフォマティクスセンターの新しい建物すごく綺麗でした。
コンクリート打ちっぱなしな雰囲気もありますが、明るい設計になっているので、なかなかよいかんじです。柏のコンクリートうちっぱなしの建物の暗い？印象とはずいぶん違います。

東京に戻ってきて、東京ステーションホテルなるホテルで会議に出たのですが、こんなホテルが東京駅の中にあるなんて初めて知りました。
なかなかいいですね。泊まりたいか？というと微妙ですが。

の査読って14日以内、ってのは早すぎ。。気づいたら明日までに読まないといけなくなっていたりします。
生物系だと、中身なんて読むだけだからさっさと査読できる、ってのはあるとは思いますが、そうはいっても私のところに回ってくるのはアルゴリズムっぽい論文だということを考慮してほしいような。
＃とはいえ別に半日もあれば十分読めるわけで、単に自分がサボっているだけ、という説もアリ

一方で、情報科学系のジャーナルの査読は遅すぎます。Algorithm系の雑誌で3，4年かかったこともあるけど、いったいどこでそんなに時間がかかるんだか。。

異動の季節のようで、私が元いた会社でも知り合いが2人ほど退職して大学に出る、と聞きました。一年前送別会に出てくれた人が送られる側になっていると聞くと少し感慨深いです。

さて、授業の準備で忙しくなる前に論文を書き上げねば。。

初めて4ボールのファウンテンを100キャッチ以上できました。113キャッチ。これ以上は数えるのが大変かも。

SETIで宇宙人を探すのをみんなのPCで、という話がありましたが、こちらは、系外惑星を同じように探して、自分のPCで見つけたらその惑星に自分で名前がつけられる！という美味しい話。まだ企画段階ですが。
http://www.planetquest.org/

今月１７・１８日はアルゴリズム研究会＠東芝とコンピュテーション研究会＠東工大です。奮ってご参加下さい。（誰にいっているのだろう？）
http://www.hirata.nuee.nagoya-u.ac.jp/sigal/prog16/prog17-3.html
http://www.ieice.org/ken/program/index.php?mode=program&tgs_regid=f07dc56f56e5274cf172e41c2f6f1880b9d4885665465f508cd036dd49ac7f59&tgid=COMP&layout=html2&lang=l

ひさしぶりにＦＯＣＳセミナーに出かけてみようと思っています。
案内が来て初めてまだ去年のＦＯＣＳの論文をチェックしていなかったことに気づきました（恥）
いつもはＦＯＣＳよりＳＯＤＡとかの方が面白いと感じているのですが、去年のＦＯＣＳはいくつか面白いのがあったみたいなので読んどかないといけないですね。
プロシーディングはコンピュータ科学専攻にいけばあるかな。。。

http://www.wired.com/news/technology/0,1282,62066,00.html?tw=wn_tophead_6
シロイヌナズナに二酸化窒素に反応して赤くなる遺伝子をほりこんだそうです。
で何をするかっていうと、地雷を見つけるのに使うことを考えているらしいですね。しかし、地雷を発見するこのシロイヌナズナを植えるためには、丹念に草取りをしないといけない、というところに注意（笑）

明日は↑に日帰り出張です。